| 序号 | 项目课题名称 | 编号 | 负责人 | 起止时间 | 经费 （万元） | 资助类别/部门 |
| 1 | 蛋白质修饰组的高维度鉴定及其功能网络 | 2017YFA0505100 | 何庆瑜 | 2017-2022 | 3124 | 国家重点研发计划 |
| 2 | 多物种蛋白质/多肽组精准从头测序应用研究 | 2022YFA1304604 | 何庆瑜（课题） | 2022-2027 | 584.8 | 国家重点研发计划 |
| 3 | 干细胞成瘤的时空演化规律及干预策略 | 2022YFA110390 | 陈良（课题） | 2023-2027 | 210 | 国家重点研发计划 |
| 4 | 人类蛋白质组计划2.0-蛋白质组学驱动的精准医学计划 | 2020YFE0202200 | 王通 | 2020-2023 | 43.71 | 国家重点研发计划 |
| 5 | 结肠癌及其相关巨噬细胞的分泌蛋白质组与肿瘤发展的相关性研究 | 2014CBA02002 | 何庆瑜 | 2013-2017 | 435 | “973”项目课题 |
| 6 | “中国人类蛋白质组草图”子课题 | 2014CBA02000 | 王通 | 2014-2019 | 97 | 国家973项目 |
| 7 | “万人计划”青年拔尖人才支持经费 | 55540035 | 张弓 | 2015-2018 | 170 | 万人计划 |
| 8 | 铁蛋白介导的化脓链球菌铁转运分子机制 | 21271086 | 何庆瑜 | 2013-2016 | 80 | 国家自然科学基金面上项目 |
| 9 | 携HIV-1 gp120 DNA的巨噬细胞经exosome对肺癌细胞的输入性翻译调控研究 | 81372135 | 王通 | 2014-2017 | 73 | 国家自然科学基金面上项目 |
| 10 | 肺炎链球菌锌离子摄取关键脂蛋白AdcA和AdcAll金属结合特性的研究 | 21315023 | 孙雪松 | 2016-2019 | 72 | 国家自然科学基金面上项目 |
| 11 | 肺炎链球菌SPD_0310蛋白介导的转铁机制及其在细菌毒力方面的功能研究 | 21977037 | 孙雪松 | 2020-2023 | 66 | 国家自然科学基金面上项目 |
| 12 | 人类新蛋白UBAP1-AST6的发现及其功能研究 | 31570828 | 何庆瑜 | 2016-2019 | 62 | 国家自然科学基金面上项目 |
| 13 | 细胞周期调节因子KCTD12的发现及其调控机制 | 31770888 | 何庆瑜 | 2018-2021 | 60 | 国家自然科学基金面上项目 |
| 14 | 系统干预翻译起始效率以对抗肺癌细胞恶性表型的药理学机制研究 | 81973353 | 王通 | 2020-2023 | 55 | 国家自然科学基金面上项目 |
| 15 | 非小细胞肺癌干性抑癌基因的系统筛选及机理解析 | 81972778 | 陈良 | 2020-2023 | 55 | 国家自然科学基金面上项目 |
| 16 | 靶向Treg-FOXP3小分子抑制剂的筛选及其在肺癌免疫治疗中的作用和机制研究 | 32370966 | 周倩 | 2024-2027 | 50 | 国家自然科学基金面上项目 |
| 17 | 巴豆酰转移酶SPD_0839对肺炎链球菌铁摄取和毒力调控机制的研究 | 22377035 | 孙雪松 | 2024-2027 | 50 | 国家自然科学基金面上项目 |
| 18 | 线粒体自噬相关微蛋白介导结直肠癌奥沙利铂耐药的机制研究 | 82372691 | 汪洋 | 2024-2027 | 49 | 国家自然科学基金面上项目 |
| 19 | 肿瘤翻译组学 | 81322028 | 张弓 | 2014-2016 | 100 | 国自然优青 |
| 20 | 溶酶体相关膜蛋白LAMP2a调控肠癌耐药的作用机制及其临床意义 | 82202842 | 胡会芳 | 2023-2025 | 30 | 国家自然科学基金委员会 |
| 21 | 人肺癌细胞上皮间质转换中转录-翻译-蛋白质信息流的分子系统生物学研究 | 31800692 | 崔毅峙 | 2019-2021 | 28 | 国家自然科学基金青年项目 |
| 22 | 基于CRISPR/Cas9系统高通量筛选参与MR1转运及向MAIT抗原递呈的功能基因 | 31800723 | 周倩 | 2019-2021 | 27 | 国家自然科学基金青年项目 |
| 23 | C20orf24通过调控MAPK/ERK通路促进结直肠癌增殖的分子机制研究 | 202102020752 | 汪洋 | 2022-2024 | 24 | 国家自然科学基金委员会 |
| 24 | 建立integrative分析新策略挖掘肺腺癌致癌相关关键分子建立integrative分析新策略挖掘肺腺癌致癌相关关键分子 | 31801123 | 刘婉婷 | 2019-2021 | 17 | 国家自然科学基金青年项目 |
| 25 | 外周血超敏HIV-1核酸检测新策略及其试剂盒的产业化外周血超敏HIV-1核酸检测新策略及其试剂盒的产业化 | 2016B020238002 | 王通 | 2016-2019 | 800 | 广东省应用型科技研发重大专项 |
| 26 | Development of small molecular inhibitor against NKP46 | 陈良 | 2020-2023 | 18万美元 | Antidote Health Foundation For cure of Cancer/2021 AHFCC Free Exploration Award (FEA) | |
| 27 | 晚期肺癌的精准医学临床应用研究 | 2017B020227001 | 陈良 | 2017–2019 | 60 | 广东省科技计划重点项目 |
| 28 | “广东特支计划”杰出人才（南粤百杰） | ZX20200327 | 何庆瑜 | 2020-2023 | 120 | 广东省特支计划 |
| 29 | 功能蛋白质研究与抗癌药物靶标发现 | S2013030013315 | 何庆瑜 | 2013-2018 | 200 | 广东省自然科学基金团队项目 |
| 30 | 线粒体自噬相关微蛋白的鉴定及其机制探究 | 32224051 | 汪洋 | 2024-2027 | 100 | 广东省自然科学基金杰出青年基金项目 |
| 31 | 广东省自然科学基金-青年提升项目 | 2023A1515030115 | 汪洋 | 2023-2025 | 30 | 广东省科技厅 |
| 32 | 盐酸西那卡塞作为新型抗菌剂的抗菌效果的评价和靶点机制研究 | 2022A1515010674 | 孙雪松 | 2022-2024 | 10 | 广东省自然基金委 |
| 33 | 基于二氧化锰纳米颗粒递送TRIM21蛋白抑制肺腺癌增殖和转移的作用及机制研究 | 2023A1515011221 | 高学娟 | 2023-2025 | 10 | 广东省基础与应用基础研究基金委员会 |
| 34 | PPM1G调控ITGB4可变剪接的分子机制及其在肝细胞癌转移中的作用 | 2022A1515012388 | 张志毅 | 2022-2024 | 10 | 广东省基础与应用基础研究基金委员会 |
| 35 | MEST促进肺腺癌恶性发展的生物学 功能及临床意义研究 | 2019A1515010196 | 汪洋 | 2019-2022 | 10 | 广东省自然科学基金面上项目 |
| 36 | JNU-12调控巨噬细胞极化实现肿瘤免疫治疗的作用及机制 | 周倩 | 2021-2023 | 10 | 广东省自然科学基金面上项目 | |
| 37 | GSN（凝溶胶蛋白）mRNA的 3’UTR 在肺腺癌细胞中的功能及分子机制 | 2019A1515010182 | 刘朗夏 | 2019-2022 | 10 | 广东省自然科学基金面上项目 |