个人简介:
赵晶，博士，暨南大学生命科学技术学院特聘副研究员。博士毕业于2014年，华南农业大学亚热带农业生物资源保护与利用国家重点实验室，师从刘耀光院士；随后入职暨南大学生命与健康工程研究院进行博士后研究。中国遗传学会遗传咨询分会会员，广东省科技特派员。现主要从事蛋白质翻译相关应用基础研究，利用分子生物学、翻译组、蛋白质组等手段对隐藏蛋白质组（Dark proteome）进行深入探索。以第一作者或参与者在国内外知名期刊发表十余篇SCI论文，包括Nucleic Acids Research、New Phytologist、Frontiers in Genetics、Biotechnology for Biofuels等。先后主持中国博士后基金面上项目，作为主要成员参与多个国家自然科学基金面上项目，973项目以及国家重点研发计划等，获得国家专利授权3项。
职称/职务：特聘副研究员
社会职务：
2017-今 中国遗传学会，遗传咨询分会会员
2023-今 广东省科技庁，农村科技特派员
学习经历：
2003-2007，内蒙古农业大学，生物工程学院，生物技术，理学学士，师从高峰教授
2007-2010，华南农业大学，生命科学学院，亚热带农业生物资源保护与利用国家重点实验室，生物化学与分子生物学，理学硕士，导师郭晶心研究员
2010-2014，华南农业大学，生命科学学院，亚热带农业生物资源保护与利用国家重点实验室，生物化学与分子生物学，理学博士，导师刘耀光院士
工作经历：
2014-2020，暨南大学，生命科学技术学院/生命与健康工程研究院，博士后（合作导师张弓教授）
2020-至今 ，暨南大学，生命科学技术学院/生命与健康工程研究院，特聘副研究员
研究方向：
主要研究方向包括利用生物化学与分子生物学、蛋白质组学以及翻译组学解析隐藏蛋白质组和蛋白质翻译状态、开发建立新的翻译组技术方法、对植物重要性状相关基因的功能研究等。
广义的翻译组(Translatome，参见网站translatome.net )指直接参与蛋白质翻译过程的所有元件，包括核糖体、正在翻译的mRNA、tRNA、调控性RNA(如miRNA等)、新生肽链及其他各种翻译因子等，狭义的翻译组特指正在翻译的mRNA(translating mRNA)。翻译是高度动态的过程，通常活跃翻译的mRNA结合着一个或多至数十个核糖体生产蛋白质。然由于细胞中存在着普遍的翻译调控，存在部分mRNA不进入核糖体参与蛋白质翻译，此外核糖体密度与翻译活性之间相关性也并不总是一致，导致mRNA表达水平与蛋白质表达水平之间的相关性不高。因此本课题组采取专一性地分离与研究与核糖体结合的RNC-mRNA(ribosome nascent chain complex-bound mRNAs, RNC-mRNAs)，期望更精确的表征正在合成蛋白质的种类及其表达量。
水稻（Oryza sativa L.）是世界上最重要的粮食作物，全世界50%以上的人口是以稻米为主食，而其中超过90%的水稻产于亚洲。自2002年第一张水稻基因组精细图谱公布以来，助力了大批控制产量、品质、抗逆基因的克隆。然而至今，水稻蛋白质组方面研究仍严重滞后于基因组研究，有待进一步完善。本课题组通过翻译组测序（RNC-seq）直接获得与核糖体结合的翻译中mRNA，结合蛋白质组质谱鉴定技术，高通量地为大量水稻基因获取了蛋白质水平翻译证据；此外在水稻翻译组中发现数万全新可变剪切位点，意味着依然存在大量正在翻译的“隐藏蛋白质”等待进一步研究发现。为高质量地发掘水稻的“隐藏蛋白质组”，课题组通过高通量翻译组测序以及分子生物学、生物信息学分析等手段，“干湿结合”进行深度挖掘和鉴定，对隐藏蛋白质进行探索。
主要论文：
Degui Zhou, Yajing Li, Xianrong Xie, Wenyan Ding, Libin Chen, Tie Li, Jianian Tang, Xiyu Tan, Weizhi Liu, Yueqin Heng, Yongyao Xie, Letian Chen, Qi Liu, Shaochuan Zhou, Jing Zhao, Gong Zhang, Jiantao Tan, Yaoguang Liu, Rongxin Shen,Copy number variation of NAL23 causes narrow-leaf development in rice, Journal of Genetics and Genomics, 2024,
Gu Wei, Wang Yubin, Xu Ran, Li Jiamin, Jin Jingjie, Zhao Jing, Chen Yang, Lu Yuanzhi, Zhang Gong. Experimental assessment of robust reference genes for qRT-PCR in lung cancer studies .Frontiers in Oncology. 2023(13). DOI=10.3389/fonc.2023.1178629
Wu, Chun; Lu, Xiaolong; Lu, Shaohua; Wang, Hongwei; Li, Dehua; Zhao, Jing; Jin, Jingjie; Sun, Zhenghua; He, Qing-Yu; Chen, Yang; Zhang, Gong. Efficient Detection of the Alternative Spliced Human Proteome Using Translatome Sequencing. Frontiers inMolecular Biosciences (2022) 9. DOI: 10.3389/fmolb.2022.895746
Huiying Fang, Guandi Zeng, Wei Gu, Yubin Wang, Jing Zhao, Tingkai Zheng, Lina Xu, Yutong Liu, Jinning Zhang, Xuesong Sun* and Gong Zhang* Genome recombination-mediated tRNA up-regulation conducts general antibiotic resistance of bacteria at early stage. Frontiers in Microbiology (2022), DOI: 10.3389/fmicb.2021.793923
Man Zhang, Jing Zhao, Wanying Li, Shuqi Wen, Huiling Huang, Jie Dong, Bing Liu, Gong Zhang, Hong-Bin Wang, Yanting Shen *, Hong-Lei Jin *. Increased photosystem II translation efficiency as an important photoprotective mechanism in an Arabidopsis thaliana ecotype (Tibet-0) adapted to high light environments. Environmental and Experimental Botany (2021) 183:104350.
Zong, Wubei; Ren, Ding; Huang, Minghui; Sun, Kangli; Feng, Jinglei; Zhao, Jing; Xiao, Dongdong; Xie, Wenhao; Liu, Shiqi; Zhang, Han; Qiu, Rong; Tang, Wenjing ; Yang, Ruqi; Chen, Hongyi; Xie, Xianrong; Chen, Letian; Liu, Yao-Guang*, Guo, Jingxin*. Strong photoperiod sensitivity is controlled by cooperation and competition among Hd1, Ghd7 and DTH8 in rice heading. New Phytologist(2020), DOI: 10.1111/nph.16946
Shaohua Lu† , Jing Zhang† , Xinlei Lian† , Li Sun , Kun Meng, Yang Chen, Zhenghua Sun, Xingfeng Yin, Yaxing Li, Jing Zhao, Tong Wang* , Gong Zhang* and Qing-Yu He*. A hidden human proteome encoded by‘non-coding’genes. Nucleic Acids Research(2019), 47(15), 8111–8125
Zhao J#, Zhang H, Qin B, Nikolay R, He QY, Spahn CMT *, Zhang G *. Multifaceted stoichiometry control of bacterial operons revealed by data-independent acquisition mass spectrometry. Frontiers in Genetics (2019).10:473
Liao X, Zhao J, Liang S, Jin J, Li C, Xiao R, Li L, Guo M, Zhang G *, Lin Y *. Enhancing co-translational folding of heterologous protein by deleting non-essential ribosomal proteins in Pichia pastoris. Biotechnology for Biofuels (2019), 12:38.
Zhao J#, Qin B, Nikolay R, Spahn CMT, Zhang G*. Translatomics: The Global View of Translation. International Journal of Molecular Sciences (2019) 20(1), 212.
Zhao Panpan, Zhong Jiayong, Liu Wanting, Zhao Jing, , Zhang Gong*. Protein-level integration strategy of multi-engine MS spectra search results for higher confidence and sequence coverage. Journal of Proteome Research, 2017, 16(12).
赵晶#, 张弓*. 翻译组学:方法及应用. 生命的化学, 2017(1):70-79.
Zhao Jing#, Chen Hongyi, Ren Ding, Tang Huiwu, Qiu Rong, Feng Jinglei, Long Yunming, Niu Baixiao, Chen Danping, Zhong Tianyu, Liu Yaoguang* & Guo Jingxin*. Genetic interactions between diverged alleles of Early heading date 1 (Ehd1) and Heading date 3a (Hd3a)/ RICE FLOWERING LOCUS T1 (RFT1) control differential heading and contribute to regional adaptation in rice (Oryza sativa). New Phytologist, 2015, 208(3):936.
承担课题：
国家重点研发计划，植物源复杂结构天然化合物的生物合成途径解析及异源合成（大数据驱动的复杂生物合成途径解析），2023-12 至 2028-11，1700万元，在研，参与。
国家自然科学基金委员会，面上项目，一种新型的PPR蛋白介导水稻叶绿体RNA编辑调控侧芽发育的分子机制研究，2022-01至2025-12，58万元，在研，参与。
国家自然科学基金委员会，面上项目，肺炎链球菌SPD_0310蛋白介导的转铁机制及其在细菌毒力方面的功能研究，2020-01至2023-12，66万元，结题，参与。
中国博士后科学基金，面上项目，利用翻译组测序提高水稻蛋白质组质谱鉴定效率的研究，2016-07至2020-10，5万元，结题，主持。
国家自然科学基金，面上项目，叶绿体定位的假定I型DNA拓扑异构酶控制水稻强光周期敏感性的分子机理，2014-1至2017-12，80万元，结题，参与。
973项目，主要农作物生殖发育的分子机理及调控技术子课题-花期调控的分子机理，2013-01至2017-12，43万元，结题，参与。
授权专利：
赵晶，张弓, 完整获取植物组织中核糖体新生肽链复合物的方法与应用。CN201510332732.5
赵盼盼，钟嘉泳，张弓，杜高飞，赵晶，金静洁，一种去除总RNA样品中核糖体核酸rRNA的方法和组合物。CN106399533
张鸿，张弓，赵晶，金静洁，一种构建Ribo-seq测序文库的方法。CN108624651
电子邮箱：qzhaojing@jnu.edu.cn
办公地址：暨南大学第二理工楼920