宣佳佳 助理研究员

发布者：张志毅发布时间：2026-03-31浏览次数：558

个人简介：

宣佳佳，博士，硕士研究生导师，暨南大学青年拔尖人才（“青蓝学者”）。长期致力于RNA修饰的鉴定和肿瘤表观修饰研究，结合生物信息学和湿实验技术解析多物种RNA修饰图谱，揭示RNA修饰在癌症发生和进展中的调控功能。具有丰富的转录组（RNA-seq）、RNA结合蛋白靶标组（CLIP-seq）、翻译组（Ribo-seq）等数据挖掘经验及算法开发经验，在表观遗传修饰、新型非编码RNA鉴定、非编码RNA表达和调控网络及RNA-RNA结合蛋白互作网络等方面做出一系列创新性成果，成功开发了RMBase、napRNAdb、Pol3Base、deepBase、ChIPBase、starBase和NADCdb等在线数据库和分析平台，构建了HIV患者不良预后预警模型，建立了共病发生和预后的诊断模型，此外，鉴定并验证了新型m6A修饰结合蛋白的功能，解析了TP53诱导的lncRNA编码功能性多肽的机制及其抑制细胞增殖的功能，等。其中，构建的RMBase数据库和RNAEpiHub分析平台，以可视化的方式展示了RNA修饰相关的所有结果，并提供了可视化的自定义分析工具，是目前国际上最全面的RNA修饰数据库和分析平台。在国际期刊上发表多篇SCI论文，其中一篇引用超过370次。


研究方向：

1.RNA表观遗传修饰；

2.非编码RNA的鉴定、表达和调控网络；

3.肿瘤表观修饰；

4.生物信息学（算法开发、数据库搭建、web server构建、多组学数据分析等）


学习经历：

2022年：中山大学博士学位，中山大学博士研究生优秀毕业生

2018年：中山大学硕士学位


工作经历：

2022年-至今：暨南大学生命科学技术学院，助理研究员


荣誉奖励：

暨南大学生命科学技术学院2024年本科课程新任教师教学竞赛二等奖

暨南大学青年拔尖人才（“青蓝学者”）


主要论文：

  1. Xuan J, Xiao C, Luo Y, et al. NapRNAdb: a multispecies repository and analytical platform for napRNA discovery and functional annotation. Nucleic Acids Res. Published online November 3, 2025. doi:10.1093/nar/gkaf1100.

  2. Huang Y, Xuan J, Liang J, et al. A TRIM Family-Based Strategy for TRIMCIV Target Prediction in a Pan-Cancer Context with Multi-Omics Data and Protein Docking Integration. Biology (Basel). 2025;14(7):742. Published 2025 Jun 22. doi:10.3390/biology14070742.

  3. Xu Z, Huang Y, Yu X, Xuan J, Liu W. Multi-Omics Integration of Lactylation- and PANoptosis-Based Signatures in Lung Adenocarcinoma: Prognostic Stratification and Immune Response. Int J Mol Sci. 2025;26(13):5999. Published 2025 Jun 23. doi:10.3390/ijms26135999.

  4. Xuan J, Xiao C, Luo R, Luo Y, He QY, Liu W. NADCdb: A Joint Transcriptomic Database for Non-AIDS-Defining Cancer Research in HIV-Positive Individuals. Int J Mol Sci. 2026 Jan 23;27(3):1169. doi: 10.3390/ijms27031169.

  5. Xuan J, Chen L, Chen Z, Pang J, Huang J, Lin J, Zheng L, Li B, Qu L, Yang J. RMBase v3.0: decode the landscape, mechanisms and functions of RNA modifications. Nucleic Acids Res. 2024 Jan 5;52(D1):D273-D284. doi: 10.1093/nar/gkad1070.

  6. Xuan JJ, Sun WJ, Lin PH, Zhou KR, Liu S, Zheng LL, Qu LH, Yang JH. RMBase v2.0: deciphering the map of RNA modifications from epitranscriptome sequencing data. Nucleic Acids Res. 2018 Jan 4;46(D1):D327-D334. doi: 10.1093/nar/gkx934.

  7. Cai L, Xuan J, Lin Q, Wang J, Liu S, Xie F, Zheng L, Li B, Qu L, Yang J. Pol3Base: a resource for decoding the interactome, expression, evolution, epitranscriptome and disease variations of Pol III-transcribed ncRNAs. Nucleic Acids Res. 2022 Jan 7;50(D1):D279-D286. doi: 10.1093/nar/gkab1033.

  8. Xie F, Liu S, Wang J, Xuan J, Zhang X, Qu L, Zheng L, Yang J. deepBase v3.0: expression atlas and interactive analysis of ncRNAs from thousands of deep-sequencing data. Nucleic Acids Res. 2021 Jan 8;49(D1):D877-D883. doi: 10.1093/nar/gkaa1039.

  9. Huang J, Zheng W, Zhang P, Lin Q, Chen Z, Xuan J, Liu C, Wu D, Huang Q, Zheng L, Liu S, Zhou K, Qu L, Li B, Yang J. ChIPBase v3.0: the encyclopedia of transcriptional regulations of non-coding RNAs and protein-coding genes. Nucleic Acids Res. 2023 Jan 6;51(D1):D46-D56. doi: 10.1093/nar/gkac1067.

  10. Xu W, Liu C, Deng B, Lin P, Sun Z, Liu A, Xuan J, Li Y, Zhou K, Zhang X, Huang Q, Zhou H, He Q, Li B, Qu L, Yang J. TP53-inducible putative long noncoding RNAs encode functional polypeptides that suppress cell proliferation. Genome Res. 2022 Jun;32(6):1026-1041. doi: 10.1101/gr.275831.121. Epub 2022 May 24.


申请专利：

1.基于转录组测序基因表达量数据制定生物标志物参考区间的方法。


编写教材：

1.《功能蛋白质研究》


承担课题：

  1. 2025-2026年度广东省科协青年科技人才培育计划。

  2. 新型m6A读码器PABPC4的鉴定及其调控肺癌mRNA加工代谢的机制研究，2026/1-2028/12，主持。

  3. 基于高通量测序数据开发标准化算法用于精确鉴定和定量RNA修饰并解析它们的空间特异性和时间特异性，2024/1-2025/12，主持。

  4. RNA修饰蛋白图谱的构建及其在人类癌症中的驱动作用，2023/1—2024/12，主持。

  5. 新蛋白TPM3P9上调PD-L1的分子机制及其在肾透明细胞癌免疫逃逸中的作用，2026/1-2029/12，参与。

  6. 2025年暨南大学“人工智能+”课程建设项目。


讲授课程：

  1. 研究生课程：功能蛋白研究、生物信息学、高级生物化学

  2. 本科生课程：生物信息学、基因组学、生物化学与分子生物学、人工智能与生物科学


电子邮箱：xuanjj@jnu.edu.cn

办公地址：暨南大学石牌校区第二理工楼902B